24 nov 2011

Win ISI 4.4 (New update available)

You can download a new version of Win ISI 4 (4.4) that fix the bugs reported in Win ISI 4.3

Os podéis descargar la nueva actualización de Win ISI 4 (la 4.4) que soluciona los problemas reportados en la versión 4.3.

http://www.winisi.com/

WinISI version 4.4.0.13316 Update
November 11, 2011
WinISI 4.4 update includes a new discriminate technique. The algorithm is maximum X-residual and it is fully supported in ISIscan version 4.4.
The maximum X-residual models are saved in files with the extension .DC5. This discriminate techique joins the original 2-block PLS, maximim distance, correlation, Mahalanobis distance, and X-residual methods for maximum flexibility in designing your discriminate analytical system.
WinISI 4.4 update also includes some bug fixes and minor enhancements.
WinISI 4.4 is available as a free upgrade to all licensed users of WinISI 4.


If you want to use the new discriminant method DC5, you need to download the ISI Scan 4.4 also in the Win ISI web page.
Dont forget to make a copy of the DATA folder or a Backup before to update, just in case there are any problems to come back to the previous version.

23 nov 2011

Repasando Unscrambler - 005 (X- Loadings)

Hemos visto en 001, los espectros y en que zonas había una mayor varianza, con los márgenes de desviación estándar y los cuartiles. Como sabemos al calcular los componentes principales,, calculamos los "loadings" (la ya varias veces comentada Matriz "P"). Estos Loadings son espectros que nos servirán para reconstruir otros espectros. Disponemos de tantos loadings como PCs, y en el ejemplo que estamos desarrollando en este repaso, la recomendación es de 3 PCs.
El primer PC, esta relacionado con la mayor fuente de varianza espectral, una vez extraida esta varianza, se calculan los demás extrayendo las demas fuentes de varianza,...
Observar estos Loadings requiere un cierto conocimiento de espectroscopía (donde están las bandas de los diferentes analitos, interferencias,.....).

21 nov 2011

Repasando Unscrambler - 004 (Residual X - Leverage)

Este gráfico es de gran importancia, a la hora de determinar si descartamos muestras como anómalas o las mantenemos. Algunas muestras tienen un alto residual y separan del resto de muestras, pero pueden hacerlo de distinta forma. Pongamos un simple ejemplo.
Una serie de muestras se describen perfectamente con dos componentes principales, que como sabemos describen un plano. Sus proyecciones sobre dicho plano serán mas o menos pequeñas en función de su residual X, pudiendo caer sobre el mismo plano, en cuyo caso su residual sería cero. En el caso de que alguna muestra, tenga un alto residual y su proyección sobre el plano sea muy grande, dicha muestra es un anómalo por alto residual y es muy probable que tengamos que descartar dicha muestra.
Por otra parte puede haber muestras con un residual, pequeño, pero que se aparta del resto de muestras considerablemente, esta muestra se considera de gran influencia en el modelo y tiene un gran peso al describir los componentes principales. En este caso debemos de considerar el mantenerla previo estudio de la muestra (¿pertenece a la misma población?, ¿es una muestra con una concentración de analito alta?,....).
Puede ocurrir el caso en que la muestra tenga un alto residual, así como una alta influencia.
Para el ejemplo que estamos viendo en la serie "repasando unscrambler", el gráfico "Residual X vs Leverage" es:

El gráfico de barras nos muestra los residuales de validación en rojo para cada una de las muestras. Claramente destacan los de las muestras M52 (penúltimo) y H59 (último).Vemos que la muestra H59, tiene un menor residual en el modelo final (azul), pero un alto residual en el de validación, pero esto tiene su lógica, porque hemos utilizado la validación cruzada (leave one out), y cuando esta muestra esta en el grupo de validación, no hay ninguna como ella en el de calibración y el residual de validación es muy alto.


19 nov 2011

Repasando Unscrambler - 003

Realizamos el análisis de Componentes Principales para una mejor comprensión de nuestra base de datos. Los gráficos de "varianza explicada" , nos indican que tres PCs son suficiente para explicar la variabilidad de nuestros espectros.

Repasando Unscrambler - 002

Una vez observados los datos de la matriz X (espectros), observaremos los de la matriz Y (valores de referencia), y para ello como ya hemos hecho en otras ocasiones la mejor opción es el histograma.